上海交通大学医学院（原上海第二医科大学）地处上海市中心的卢湾区。

南北高架将学校分为东、西校区。东校区为主要为办公、生活区；西校区主要为教学区。学院向北紧临复兴公园，一站车程到著名的上海商业街淮海路。

周边有：中共一大会址、上海新天地、瑞金医院（原广慈医院）、卢浦大桥、地铁一号线（黄陂南路站）等。