黑龙江中医药大学总共有24个专业。黑龙江中医药大学本科专业有21个：针灸推拿学、针灸推拿学(康复)、中医学(英语)、药物制剂、中医学(临床)、中药资源与开发、生物技术(生物制药方向)、中西医临床医学、药学、护理学、中医学、针灸推拿学(英语)、康复治疗学、制药工程、食品科学与工程、公共事业管理(卫生)、公共事业管理、市场营销、生物技术、应用心理学、古典文献。黑龙江中医药大学专科专业有2个：医学美容技术、中西医结合。黑龙江中医药大学其他专业有1个：医学美容技术。